อะตอม คือ นิวเคลียร์กับอิเล็กตรอน
อะตอมมีขนาดประมาณ 0.1-0.5 นาโนเมตร คุณสมบัติเกือบทั้งหมดของอะตอมถูกกำหนดโดยจำนวนโปรตอนเรียกว่า เลขอะตอม มักเขียนแทนด้วย Z และมักใช้ชื่อธาตุแทนเลขอะตอม
ธาตุ คือ สิ่งที่ประกอบด้วยอะตอมที่มีจำนวนโปรตอนเท่ากัน
ไอโซโทป คือ อะตอมที่มีจำนวนโปรตอนเท่ากัน แต่มีนิวตรอนไม่เท่ากัน
อะตอมที่ง่ายที่สุด คือ อะตอมของไฮโดรเจน ประกอบด้วยโปรตอน 1 ตัว และ อิเล็กตรอน 1 ตัว สามารถคำนวณออบิทอลและระดับพลังงานจากสมการเชรอดิงเจอร์ได้
อะตอมที่มีอิเล็กตรอนมากกว่า 1 ตัว เช่น ฮีเลียม สามารถจัดเรียงชั้นพลังงานได้คล้ายกับอะตอมของไฮโดรเจน โดยมีออบิทอลดังนี้
1s < 2s < 2p < 3s < 3p < 4s ~ 3d < 4p < 5s
อิเล็กตรอนไม่สามารถอยู่สภาวะเดียวกันได้ ทำให้แต่ละออบิทอลมีอิเล็กตรอนได้ไม่เกิน 2 ตัว เนื่องจากมี 2 สภาวะสปินขึ้นและลง
ที่สภาวะพื้น อิเล็กตรอนจะอยู่ในออบิทอลที่พลังงานต่ำสุดเรียงขึ้นมา จนถึงออบิทอล 4s และ 3d ที่มีระดับพลังงานใกล้เคียงกัน
ระดับพลังงานรวมจะต่ำกว่าเมื่ออิเล็กตรอนอยู่ในออบิทอล 3d ครบในโครเมียม (24Cr) และทองแดง (29Cu)
การจัดเรียงอิเล็กตรอนของธาตุมีดังนี้
การจัดเรียงอิเล็กตรอนของ 36 ธาตุแรก ทำให้จัดคุณสมบัติของธาตุได้เป็น 4 แถว แถวละ 8 หมู่ กับธาตุทรานซิชัน21-30 ที่มีอิเล็กตรอนวงนอกสุดใกล้ออบิทอล 3d เรียกการจัดเรียงธาตุเป็นตารางนี้ว่าตารางธาตุ
| 1 H | 2 He | ||||||||
| 3 Li | 4 Be | 5 B | 6 C | 7 N | 8 O | 9 F | 10 Ne | ||
| 11 Na | 12 Mg | 13 Al | 14 Si | 15 P | 16 S | 17 Cl | 18 Ar | ||
| 19 K | 20 Ca | * | 31 Ga | 32 Ge | 33 As | 34 Se | 35 Br | 36 Kr | |
| 21 Sc | 22 Ti | 23 V | 24 Cr | 25 Mn | 26 Fe | 27 Co | 28 Ni | 29 Cu | 30 Zn |